هدف از انتشار فصلنامه اکوهیدرولوژی آشنا کردن اساتید، متخصصان، کارشناسان و دانشجویان رشته های مرتبط با اکوهیدرولوژی است.
با توجه به تعریفی که یونسکو از علم اکوهیدرولوژی ارائه کرده است، مطالعات اکوهیدرولوژی، ارتباط متقابل بین اکولوژی و هیدرلوژی را بررسی می کنند و هدف آن حفظ تنوع زیستی و رسیدن به حداکثر هماهنگی در فرآیندهای هیدرولوژیکی در حوزه های آبخیز می باشد. لذا زمینه هایی که این مجله مقالات تخصصی می پذیرد شامل موارد میان رشته‌ای زیر می باشند:
تأثیرات اکوهیدرولوژیکی تغییر الگوهای بارش بر سیستم‌های خاک و گیاه
استراتژی‌های سازگاری گیاهان با شرایط جوی تغییر یافته
تأثیرات بلندمدت تغییرات اقلیمی بر سلامت خاک و تولید گیاه
دینامیک رطوبت خاک و تعرق گیاه
تأثیر شرایط جوی بر وضعیت رطوبت خاک و گیاه
نقش آب در جذب و انتقال مواد مغذی
زنجیره مواد مغذی در اکوتون های آبی و خشکی
ارتباط متقابل گیاه-میکروب در چرخه مواد مغذی
مولفه‌های بیلان آب
کاربردهای سنجش از دور در مطالعات بیلان آب
استفاده از مدل‌های هیدرولوژیکی برای پیش‌بینی تغییرات بیلان آب
روش‌های میدانی برای اندازه‌گیری رطوبت خاک و نیاز آبی گیاه
کاربری اراضی و تغییرات در هیدرولوژی حوزه آبریز
تنوع زیستی و تعاملات گونه‌ها در اکوتون‌های آبی و هشکی
اکوتون‌ها به عنوان شاخص‌های تغییرات محیطی
تأثیرات آلودگی و تغذیه‌گرایی بر اکوتون‌ها
تاب‌آوری اکوهیدرولوژیک حوزه‌های آبخیز
نقش گونه‌های مهاجم و عوامل انسانی در تخریب زیستگاه‌ها
تغییرات اقلیمی و تأثیرات متفاوت آن بر اکوتون‌ها
تکنیک‌های بازسازی اکوتون‌های تخریب شده
کاربرد GIS & RS در اکوهیدرولوژی
استفاده از پهپادها و هواپیماهای بدون سرنشین در تحقیقات اکوهیدرولوژیکی
حسگرهای پایش رطوبت خاک و داده‌نگارها
فیتوسنسورها و نظارت بر وضعیت آب گیاه
استفاده از داده‌های بزرگ و یادگیری ماشین در اکوهیدرولوژی
ادغام منابع داده مختلف برای مدلسازی جامع
ابزارهای پیش‌بینی و شبیه‌سازی برای فرآیندهای اکوهیدرولوژیکی
ارزیابی کیفیت منابع آب و سلامت اکوسیستم‌ها
ردیابی جریان آب و آلاینده‌ها
تعیین منبع آب مصرفی گیاهان